眼科创建于1952年，由我国著名眼科教育家、一级教授郭秉宽开创。历经近70年的发展，我院眼科已经发展成为集医疗、教学、科研于一体、眼科亚专业门类齐全、医疗技术精湛、诊疗设备先进、科研实力强大、国内领先、国际知名的眼科中心。眼科在中国医院最佳专科声誉排行榜连续十余年稳居全国三甲。我院眼科是国家教育部重点学科和国家卫健委临床重点专科，是教育部首批硕士、博士研究生培养点和博士后流动站。眼科拥有国家卫健委近视眼重点实验室、上海市视觉损害与重建重点实验室、上海激光与裸眼3D视觉健康工程技术研究中心、上海市眼视光学研究中心、上海市近视矫治研究中心（上海市重中之重研究中心）、上海市眼科临床质量控制中心，是国家级首批住院医师规范化培训基地和上海市专科医师规范化培训基地，同时也是上海市红十字会眼库常设机构。
我院眼科如今已形成汾阳、宝庆、浦江、浦东院区和科创中心“四院区一中心”协同发展的崭新格局。眼科在职医师总人数221人，其中正高级职称38人、副高级职称57人，博士生导师30名，硕士生导师27名，人才队伍呈现年轻化，50岁及以下医师占眼科医师总人数90.5%，研究生以上学历占眼科医师总人数99.1%。专职研究人员数35人，高级职称比例28.6%。
眼科已建立起一支以优秀临床专家及科研高端人才领导的学术型专家团队，包括中华医学会眼科学分会候任主任委员1名、国家卫生健康突出贡献中青年专家4人、国家杰出青年1名，国家优青2人、上海市领军人才5名等。眼科牵头承担包括国家重点研发计划干细胞及转换研究重点专项、数字诊疗装备研发专项，国家自然科学基金重点项目、国家卫生公益性行业科研专项在内的国家和地方各类重大、重点项目，获国家技术发明奖二等奖、国家科学技术进步奖二等奖、教育部技术发明一等奖、上海市科技进步一等奖在内的四十余项省部级科研奖励。
眼科下设白内障与晶状体疾病、玻璃体视网膜疾病、青光眼及视神经疾病、视光学、眼表疾病、眼眶及眼肿瘤、小儿眼科与斜弱视以、综合眼科八个三级学科，此外还设有低视力、防盲治盲、眼中医学组及眼科检查中心。各个三级学科均衡发展，均达到国内领先水平，可比肩国际同类诊治水平。开设包括难治性青光眼诊治中心、干眼综合诊治中心、先天性白内障精准诊治中心、屈光性白内障诊治中心、眼内镜诊治中心、甲状腺眼病诊治中心、眼内肿瘤诊治中心、疑难眼底病诊治中心、先天性晶状体疾病诊治中心、黄斑病诊治中心、眼外伤诊治中心、神经眼科疾病诊治中心、高度近视眼底病诊治中心、IOL脱位微创手术中心等专病中心，每年诊治大量来自全国各地的疑难病例。我院眼科年门诊平均约为140万余人次，年总手术量9.5万余台。近年来，眼科以数字技术赋能智慧医疗，互联网门诊年服务人次达10余万人次，不断创新服务模式，始终秉持“患者利益第一、医疗质量第一”服务宗旨。全国医院互联网影响力专科排行榜，我院眼科多年来稳居全国第一/第二，已成为老百姓心目中最值得信赖的眼科专科医院之一。
